我們統(tǒng)計在2021年發(fā)表了1319篇相關的基因家族文章,而2022年到目前已經發(fā)表了1241篇(使用genome wide of gene family關鍵詞檢索)??梢钥吹交蚣易逦恼逻@種套路文章發(fā)文之大。且如果進化做的好,可以分析一個基因家族在多個物種中演化規(guī)律,即可發(fā)更高水平的文章。
2021年部分基因家族發(fā)表文章
2022年部分基因家族發(fā)表文章
隨時在線實戰(zhàn)練習
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可視化操作
為滿足初學者的需要,我們在命令行教學的同時,還準備了可視化練習的方式,讓初學者更好入門,動動鼠標即可實現(xiàn)在線分析做圖。
課件豐富
所有課程都有詳細的學習文檔,每一步的操作步驟都會在文檔中詳細列出。而且課后還可反復觀看上課視頻,有問題隨時售后群中交流溝通,真正實現(xiàn)“線上學習理解,課后練習指導,課下文檔復習”。
1、培訓形式:線上直播+錄播
2、培訓時間:2022年12月15-18日
3、培訓費用:1999元/人(含資料,一年視頻觀看及本次直播觀看權限)
日 期 | 課 程 | |
2022/12/15周四 (9:00-12:00;14:00-18:00) |
Linux基礎 | 1、Linux系統(tǒng)介紹 2、Linux常用基本命令 3、Linux文件系統(tǒng) |
2022/12/16周五 (8:30-12:00;14:00-18:00) |
基因家族文獻講解與基礎數(shù)據(jù)下載 | 1、文獻講解 2、TAIR數(shù)據(jù)庫下載家族成員 3、PlantTFDB數(shù)據(jù)庫下載家族成員 4、Pfam數(shù)據(jù)庫下載家族成員 5、NR數(shù)據(jù)庫下載家族成員 6、Uniprot數(shù)據(jù)庫下載家族成員 7、NCBI數(shù)據(jù)庫下載基因組 8、Ensemble數(shù)據(jù)庫下載基因組 9、JGI(Phytozome)下載基因組 |
家族成員鑒定 | 1、BLAST鑒定 2、HMMER鑒定 3、關鍵結構域鑒定 4、基因在染色體上定位展示 5、各成員基本信息統(tǒng)計 |
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2022/12/17周六 (8:30-12:00;14:00-18:00) |
進化樹構建 | 1、進化樹構建的基本原理 2、MEGA使用 3、IQ-TREE 4、Evolview進化樹美化 |
基因結構特征分析 | 1、MEME Motif鑒定 2、GSDS基因結構展示 3、進化與特征組合繪圖 4、啟動子鑒定 |
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2022/12/18周日 (14:00-18:00) |
共線性分析及進化分析 | 1、MCScanX軟件 2、基因組間共線性展示(JCVI) 3、ka/ks calculator 計算Ka/ks |
轉錄組表達量計算 | 1、SRA數(shù)據(jù)下載 2、hisat2-stringtie2獲取表達量 3、熱圖繪制(MEV) |
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4、金牌、鉑金會員另贈送百邁客第八屆全國功能基因組學峰會門票(峰會為>500人會議,現(xiàn)已舉辦7屆,每屆均有院士大牛參加)
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